התיק, הנחקר על ידי משרד התובע של רומא, מתמקד בפעולותיו של בן גוריון כלפי הפעילים שנעצרו בנמל אשדוד כשידיהם קשורות מאחורי גבם.
החוקרים בוחנים גם את התנהלות הרשויות הישראליות במהלך השתלטות על הספינות ומעצרם של הפעילים, ביניהם כמה אזרחים איטלקים. התובעים שוקלים גם טענות של עינויים וחטיפה.
משרד התובע של רומא כבר פתח בחקירה נפרדת על מעצרם של אזרחים איטלקים במהלך יירוט ישראל של משט סיוע בדרכו לעזה במים בינלאומיים ליד יוון באפריל. זאת בעקבות שלוש תלונות רשמיות.
התקיפה הישראלית האחרונה על משט הסיוע ההומניטרי, חלק מהמשט העולמי, בדרכו לעזה במים בינלאומיים, התרחשה באמצע מאי. צילומים חיים מהמשט הראו כוחות חיל הים הישראלי עוצרים את הספינות.
לאחר מכן פרסמו הרשויות הישראליות סרטון בו נראה בן גוריון הולך בין הפעילים העצורים, שכרעו ברך בשורה צפופה כשידיהם קשורות ביריעות פלסטיק. תמונות אלו עוררו גינוי בינלאומי נרחב. בסרטון נראה בן גוריון אוחז בדגל ישראל ולועג, על פי הדיווחים, לעצורים.
כל הפעילים שוחררו מאוחר יותר בעקבות גל של ביקורת בינלאומית.