בצו שניתן על ידי ד״ר מסעוד פזשכיאן, נשיא הרפובליקה ויושב־ראש מועצת ההגנה, מונה האמיר־אדמירל עלי שמחאני, נציג המנהיג העליון של המהפכה במועצת ההגנה, למזכיר מועצה זו.

על פי הצו, משימת מזכיר מועצת ההגנה היא הקמה וניהול של מזכירות המועצה ומעקב אחר יישום תוכניותיה המקצועיות, ובכלל זה: תכנון וחיזוק מקיף של המוכנות ההגנתית, גיבוש מנגנונים להתמודדות עם איומים מתהווים, יצירת סינרגיה בין שאר מרכיבי העוצמה של הרפובליקה האסלאמית לבין תחום ההגנה, הסדרת מסגרות לדיפלומטיה ביטחונית, וארגון פעילות תחום התקשורת האסטרטגית והלוחמה התודעתית במרחב האסטרטגי של ההגנה.

מועצת ההגנה היא מבנה שהוקם לאחר מלחמת 12 הימים ובתגובה לאיומים חדשים, ומטרתה להגביר את התיאום, הלכידות והיעילות בתהליכי קבלת ההחלטות הביטחוניות ולחזק את ההרתעה ברמות הגבוהות. האדמירל שמחאני נוכח במועצה זו מאז הקמתה כנציג המנהיג העליון של המהפכה.

האדמירל עלי שמחאני נחשב לאחד המפקדים הוותיקים והבולטים של הכוחות המזוינים. מאז ניצחון המהפכה האסלאמית ועד היום, ובמקביל לנוכחותו המשמעותית בשמונה שנות ההגנה הקדושה, מילא שורה של תפקידים, ובהם: מפקד משמרות המהפכה בח׳וזסתאן, סגן מפקד העליון של משמרות המהפכה, מפקד כוחות היבשה של משמרות המהפכה, סגן לענייני מודיעין ומבצעים במטה הכללי של הכוחות המזוינים, מפקד הכוחות הימיים של הצבא ושל משמרות המהפכה, שר ההגנה, מזכיר המועצה העליונה לביטחון לאומי ויועץ מדיני למנהיג העליון של המהפכה — והוא היה מקור לשירותים נרחבים בתחומי ההגנה והביטחון.