متن نامه تقاضای استعفای آقای بطحایی که دوازدهم خردادماه ?? تقدیم رئیس جمهوری شده، به این شرح است:
حضرت حجت الاسلام و المسلمین جناب آقای دکتر روحانی ریاست محترم جمهوری اسلامی ایران با سلام و آرزوی قبولی طاعات و عبادات،
از آنجائیکه اینجانب قصد کاندیدائی برای نمایندگی مجلس شورای اسلامی را دارم و با توجه به مهلت قانونی مقرر (??/?/??) بدین وسیله استدعا دارم با درخواست استعفای اینجانب موافقت فرمائید.
از اینکه با اعتماد به اینجانب، فرصت همراهی با دولت دوازدهم و خدمت را برایم فراهم آوردید، بسیار سپاسگزارم.
ارادتمند - سیدمحمد بطحائی – ????/?/??
پس از پیگیری آقای بطحائی بر پذیرش استعفا، رئیس جمهور روز سه‌شنبه مورخه چهاردهم خردادماه ??، با درخواست وی موافقت و در جواب نامه استعفای آقای بطحائی نوشت:
بسمه تعالی
جناب آقای سیدمحمد بطحائی دام عزه
با تشکر از زحمات جنابعالی در دوران مسئولیت وزارت آموزش و پرورش و با توجه به تصمیم جنابعالی برای شرکت در انتخابات مجلس شورای اسلامی به‌عنوان کاندیدای نمایندگی، با استعفای جنابعالی موافقت می‌کنم. توفیق روزافزون جنابعالی را از خداوند بزرگ، مسألت می‌نمایم.