سازمان انرژی اتمی ایران در واکنش به تجاوز رژیم صهیونیستی به خاک جمهوری اسلامی ایران، بیانیه‌ای منتشر کرد که در آن آمده: «این اقدام رژیم صهیونیستی مغایر با قوانین بین‌المللی از جمله مصوّبات شورای حکام، کنفرانس عمومی و شورای امنیّت سازمان ملل می‌باشد.»
نورنیوز ـ گروه سیاسی: در بیانیه سازمان انرژی اتمی ایران در ارتباط با حمله رژیم صهیونیستی به خاک ایران آمده است: «سحرگاه و صبح امروز رژیم صهیونیستی در اقدامی ددمنشانه و مغایر با قوانین بین‌المللی ضمن حمله به مناطق مسکونی، تعدادی از فرماندهان نظامی و دانشمندان به همراه جمعی از شهروندان شامل زنان و کودکان را به شهادت رساند. سازمان انرژی اتمی ایران با ابراز مراتب تسلیت و تبریک شهادت مظلومانه فرماندهان، دانشمندان و نیز شهروندان کشورمان به اطلاع می‌رساند که در حمله به مجتمع غنی¬سازی شهید احمدی روشن (نطنز) آسیب‌هایی به بخش¬های مختلف این مجتمع وارد شده است. بررسی¬ها درخصوص میزان آسیب¬های وارده در حال انجام است.
تاکنون هیچگونه گزارشی حاکی از خسارات جانی به نیروهای مستقر در سایت مذکور دریافت نشده است.
در بررسی‌های صورت گرفته مشخص شد که هیچگونه آلودگی پرتوی و شیمیایی به بیرون از سایت تسرّی نیافته است.
این اقدام رژیم صهیونیستی مغایر با قوانین بین‌المللی از جمله مصوّبات شورای حکام، کنفرانس عمومی و شورای امنیّت سازمان ملل می‌باشد.
طی دو سال گذشته و به دنبال تهدیدات مکرّر رژیم صهیونیستی علیه تأسیسات هسته‌ای کشورمان، رئیس سازمان انرژی اتمی با ارسال نامه‌های مختلف بعنوان آقای گروسی مدیر کل آژانس بین‌المللی انرژی اتمی و نیز طی مذاکرات صورت گرفته با وی با توجه به مسئولیت‌های قانونی او خواستار محکومیت این تهدیدات از جانب ایشان شده بود که متأسفانه تا این لحظه حتی پس از وقوع حمله، مدیر کل هیچگونه اقدامی در اینخصوص انجام نداده است. این در حالی است که آژانس با تهیه گزارشات سیاسی مغرضانه براساس اطلاعات جعلی دریافتی از جانب رژیم صهیونیستی عملاً از مسیر حرفه¬ای و بیطرفی خارج شده است.
سازمان انرژی اتمی ایران این سکوت را نوعی همراهی با رژیم صهیونیستی تلقی نموده و معتقد است بدین¬ترتیب آژانس تا حد تبدیل شدن به ابزاری در دست رژیم صهیونیستی تنزل یافته و اعتبار خود را بعنوان یک سازمان معتبر بین‌المللی از دست داده است. این حمله شکستی برای آژانس بین‌المللی انرژی اتمی بدلیل کوتاهی‌های غیرقابل توجیه و عدم ایفای نقش حرفه¬ای و بیطرفانه مدیر کل از جمله در تأمین امنیت تأسیسات صلح‌آمیز هسته‌ای تحت نظارت آژانس می‌باشد.
هیچ تردیدی نیست که فشارهای سیاسی که این بار با فشارهای نظامی نیز همراه شده است. خللی در عزم دانشمندان و متخصصین و کارکنان این صنعت افتخارآفرین وارد نخواهد کرد. این افتخارآفرینان برعکس خواسته¬های دشمنان با انگیزه¬ای دوچندان، اهداف عالیه کشور در اعتلای هرچه بیشتر صنعت هسته‌ای را دنبال خواهند نمود.»